Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Krt78E9Q0F0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Krt78E9Q0F0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms