Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd1E9PZ26 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms