Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc175E9PVB3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms