Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Syde2E9PUP1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms