Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce3B5KM66 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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