Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NhsB1AV60 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms