Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms