Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms