Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vamp5Q9Z2P8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms