Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl8Q9Z121 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl8Q9Z121 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms