Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms