Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Trim44Q9QXA7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Trim44Q9QXA7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim44Q9QXA7 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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