Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdcQ9QW08 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms