Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Sfmbt1Q9JMD1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Sfmbt1Q9JMD1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sfmbt1Q9JMD1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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