Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms