Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scamp5Q9JKD3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms