Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clstn1Q9EPL2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms