Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Bap18Q9DCT6 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Bap18Q9DCT6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Bap18Q9DCT6 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Bap18Q9DCT6 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Bap18Q9DCT6 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Bap18Q9DCT6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Bap18Q9DCT6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Bap18Q9DCT6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Bap18Q9DCT6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Bap18Q9DCT6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Bap18Q9DCT6 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Bap18Q9DCT6 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Bap18Q9DCT6 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms