Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ndufs3Q9DCT2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms