Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xab2Q9DCD2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms