Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hmg20aQ9DC33 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hmg20aQ9DC33 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms