Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Csnk1dQ9DC28 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Csnk1dQ9DC28 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Csnk1dQ9DC28 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Csnk1dQ9DC28 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Csnk1dQ9DC28 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms