Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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Rnf6Q9DBU5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Rnf6Q9DBU5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Rnf6Q9DBU5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Rnf6Q9DBU5 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Rnf6Q9DBU5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Rnf6Q9DBU5 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Rnf6Q9DBU5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Rnf6Q9DBU5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf6Q9DBU5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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