Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ccdc97Q9DBT3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ccdc97Q9DBT3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ccdc97Q9DBT3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ccdc97Q9DBT3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ccdc97Q9DBT3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ccdc97Q9DBT3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc97Q9DBT3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ccdc97Q9DBT3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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