Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Capns2Q9D7J7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms