Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Srp19Q9D7A6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Srp19Q9D7A6 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Srp19Q9D7A6 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Srp19Q9D7A6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Srp19Q9D7A6 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Srp19Q9D7A6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Srp19Q9D7A6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Srp19Q9D7A6 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Srp19Q9D7A6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Srp19Q9D7A6 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms