Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nop56Q9D6Z1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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