Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy3Q9D394 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms