Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hddc3Q9D114 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms