Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Rfc5Q9D0F6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Rfc5Q9D0F6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Rfc5Q9D0F6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Rfc5Q9D0F6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Rfc5Q9D0F6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Rfc5Q9D0F6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Rfc5Q9D0F6 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Rfc5Q9D0F6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Rfc5Q9D0F6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rfc5Q9D0F6 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms