Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tdrd12Q9CWU0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms