Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pard3bQ9CSB4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pard3bQ9CSB4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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