Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccer1Q9CQL2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms