Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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