Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bhlhe41Q99PV5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms