Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SrrtQ99MR6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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