Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Med28Q920D3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms