Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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