Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OptnQ8K3K8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms