Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Lrrtm1Q8K377 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Lrrtm1Q8K377 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Lrrtm1Q8K377 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Lrrtm1Q8K377 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Lrrtm1Q8K377 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Lrrtm1Q8K377 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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