Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Lrit1Q8K099 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Lrit1Q8K099 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrit1Q8K099 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Lrit1Q8K099 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Lrit1Q8K099 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Lrit1Q8K099 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Lrit1Q8K099 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Lrit1Q8K099 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Lrit1Q8K099 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrit1Q8K099 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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