Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Znf628Q8CJ78 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Znf628Q8CJ78 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Znf628Q8CJ78 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Znf628Q8CJ78 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Znf628Q8CJ78 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Znf628Q8CJ78 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Znf628Q8CJ78 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms