Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

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Length 1,081 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Tshz3Q8CGV9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Tshz3Q8CGV9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Tshz3Q8CGV9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Tshz3Q8CGV9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Tshz3Q8CGV9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Tshz3Q8CGV9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Tshz3Q8CGV9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Tshz3Q8CGV9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Tshz3Q8CGV9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tshz3Q8CGV9 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Tshz3Q8CGV9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms