Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rbm28Q8CGC6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rbm28Q8CGC6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rbm28Q8CGC6 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbm28Q8CGC6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm28Q8CGC6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Rbm28Q8CGC6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm28Q8CGC6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbm28Q8CGC6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm28Q8CGC6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm28Q8CGC6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm28Q8CGC6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm28Q8CGC6 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm28Q8CGC6 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm28Q8CGC6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbm28Q8CGC6 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm28Q8CGC6 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm28Q8CGC6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm28Q8CGC6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbm28Q8CGC6 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm28Q8CGC6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm28Q8CGC6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm28Q8CGC6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm28Q8CGC6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm28Q8CGC6 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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