Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc178Q8CDV0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms