Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ephb1Q8CBF3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ephb1Q8CBF3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms