Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp44Q8C2S0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp44Q8C2S0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp44Q8C2S0 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usp44Q8C2S0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp44Q8C2S0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms