Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ube3dQ8BX13 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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