Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg4bQ8BGE6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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