Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrrtm2Q8BGA3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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